Většina bakterií se chová při kontaktu s hostitele pasívně, protože zde nenajde vhodné podmínky pro růst a množení, některé druhy ale mají schopnost hostitele kolonizovat a infikovat. Při nerovnovážném vztahu může dojít k poškození hostitele, což se projeví propuknutím infekčního onemocnění.